Niwa Makoto saat ini baru saja pindah dari desa ke sebuah kota dengan tujuan melanjutkan sekolahnya dan tinggal bersama bibinya, Meme Towa, yang merupakan satu-satunya keluarganya di Kota.
Saat pertama kali datang kerumah bibinya tersebut, ia merasa aneh saat pertama kali melihat anak dari bibinya tersebut terbalut dengan selimut dibadannya, ia adalah Erio Towa. Erio bertingkah aneh dan selalu mengurung dirinya dalam kamar serta maniak terhadap hal yang berbau dengan Alien.
Dengan kehidupan barunya yang aneh inilah Makoto membutuhkan waktu beradaptasi disana dan ia pun semakin penasaran apa yang sebenarnya terjadi terhadap Erio. Makoto yang kini semakin dekat dengan Erio membuat hidup Makoto perlahan-lahan berubah secara drastis.
Bercerita tentang kehidupan para siswa SMA yang bodoh dan kekonyolan mereka setiap hari.
Tadakuni, Hidenori, dan Yoshitake mereka adalah siswa yang bersekolah di SMA Sanada Utara yang merupakan sekolah khusus laki-laki.
Tak ada alur cerita khusus dari anime ini, namun kisah aneh, bodoh, dan tingkah laku mereka yang membuat kehidupan mereka tak luput dari gelak tawa dan kekonyolan mereka sendiri. Bukan hanya mereka saja bahkan adik-adik mereka dan teman disekolah mereka membuat cerita ini berwarna.
Namun hal itulah yang membuat pertemanan mereka semakin erat.
Menceritakan tentang Akari, ia berasal dari planet Man-home yang dulunya adalah bumi yang pindah ke planet Aqua yang dulunya Mars, untuk dapat menjadi undine adalah gelar seorang pemandu wisata menggunakan gondola terbaik yang dapat menemani para turis yang ingin berkeliling di kota neo venezia. Akari mempunyai cita-cita untuk menjadi “prima undine” sebutan untuk gelar teratas dari pemandu wisata. Saat di planet Aqua Akari bertemu dan berteman dengan sesama undine yang punya tujuan sama yang ingin menjadi salah satu prima undine. Mereka berlatih bersama-sama untuk menutupi kekurangan masing-masing, mengejar tujuan dan cita-cita menjadi prima undine.
Anime Aria ini memiliki genre utama Slice of life, merupakan salah satu anime genre slice of life yang bagus sekali. dimana anime ini menggambarkan harapan setiap orang yang ingin merasakan kesejukan, kehangatan, ketentraman, dan kedamaian.
Anime ini juga dapat membuka perasaan semua orang dalam berbagai hal kecil yang secara umum dibenci menjadi hal yang seharusnya dapat dinikmati dan juga disenangi. Saat menonton anime Aria, orang yang melupakan berbagai hal-hal kecil tersebut dapat menyadari bahwa kita tidak seharusnya membenci.